玻尿酸隆鼻的副作用有局部组织会肿胀，因为任何组织在受伤后都会有一个水肿的时间，一般是1-3天。鼻子注射玻尿酸隆鼻后，也有一个水肿和恢复的时间。一般要求注射后24小时内不能沾水，因为局部会有针孔，需要恢复时间。
栓塞周围血管是最严重的副作用，主要是因为玻尿酸注射的针头较细，容易注射至血管内，进而可能引起周围血管的栓塞，导致供血区域组织的坏死，严重时还可能造成失明。如果栓子进入颅内，甚至还可能会引起脑部组织的坏死，造成偏瘫等严重后果。
玻尿酸隆鼻维持的效果较为短暂，由于人体内有玻尿酸酶可以溶解玻尿酸，大概1年左右就需重新注射。若未严格掌握玻尿酸的注射量及注射层次、部位，就可能会导致组织的下移，如下移至鼻尖或扩散至鼻背。
