商检证书分很多种。除了用于报关的通关单之外，还有品质证，重量证，数量证，植检证，熏蒸证，卫生证（健康证），兽医证，黄曲霉证，辐射证，一般原产地证，FORM A原产地证，残损证，等等。
这些证书的作用都不太相同。
一种作用是用来通关。很多进口的东西，在进口国通关时，都要凭出口国的原产地证，植检证，卫生证等商检证书方可办理报检手续。
另一种作用是结汇。很多收货人在信用证中规定，凭提单，品质证，重量证，植检证，熏蒸证交单方能结汇。
或者是凭重量证上的重量来确定计费重量的。
还有一种作用是鉴定。象有的货进口来了，有破损，则需要商检局检验出残损报告，用来跟发货人索赔。
其他的作用也有，但都不是主要作用了。有的也只是客户为了证明自己货物质量的一种凭证。
对外贸易有关各方履行契约义务、处理索赔争 议和仲裁、诉讼举证，具有法律依据的有效证件，也是海关验放、征收关税和优惠减免关税的必要证明。
