导致肌肉萎缩的原因主要有遗传因素、神经因素、外伤和其他疾病。
一、遗传因素
遗传因素可导致肌肉萎缩，如进行性肌营养不良症，是一组遗传性肌肉变性疾病，表现为缓慢进行性加重的对称性肌肉无力和萎缩，无感觉障碍。除此以外，还有线粒体肌病等。
二、神经因素
神经系统的病变可引起神经信号传导障碍，从而引起部分肌纤维废用，运动能力减低，导致废用性的肌肉萎缩；此外当神经元受到损伤后，其末梢释放乙酰胆碱减少，神经营养作用减弱从而引起肌肉萎缩。
三、外伤
当发生骨折时，由于患肢长期固定，不能活动等原因，会导致肢体活动减少，出现废用性肌肉萎缩；此外，骨折可能会损伤周围神经或导致脊髓、神经受压，从而出现肌肉萎缩。
四、其他疾病
颈椎病、腰椎间盘突出、肿瘤等均可造成相应部位脊髓、神经受压，可能引起肌肉萎缩；营养不良、库欣综合征、甲状腺功能亢进等也会导致肌肉萎缩；此外慢性感染也会引起肌肉萎缩。
